據中評社報道，馬英九4日下午在國民黨中常會聽取“內政部次長”蕭家淇專案報告“康妮臺風救災處置作為”，他重話反擊云嘉南高屏等5位南部綠營執政縣市長稱治水預算不足導致釀災的說法。他表示，有些該開設防災應變中心而沒有，以至于錯過判斷時間，來往都有書面證據，這跟預算沒有關系。

　　國民黨4日下午舉行中常會，“內政部次長”蕭家淇專案報告“康妮臺風救災處置作為”，蕭家淇結論指出這次小臺風帶來豪大雨，臺當局依規定要求地方開設災害應變中心，屏東、高雄、臺南、云林、嘉義等5個南部釀災縣市卻有延后開設的情況，以致錯失判斷時機。

　　馬英九裁示時表示，小臺風大豪雨在臺灣已經變成常見的現象，雨災造成損害遠大于風災。通常都是臺當局遇到地方資源不足提供協助；這方面都已制度化，事前要做好開設，相關單位就可以投入、協助救災。

　　他指出，這次出問題，蕭家淇說得很清楚，有些地方該開設防災應變中心而沒有，以至于錯過判斷時間。來往都有書面證據，這跟預算沒有關系，這是地方政府警覺性夠不夠、以及災害應該是否完備的考量，這方面的確有加強必要。

　　馬英九說，“水利署”的8年新臺幣800億治水預算，他在過成中有參與執行，確實有進步；后續治水預算錢撥下去作了什么事、發揮什么用途？都要檢討；這次徹底檢討后，把錢花在刀口上，一定會有進步。

　　據臺灣《聯合報》報道，蕭家淇說，根據地方制度法，雨水下水道建設管理及預算都是地方政府自治事項。以2012年度縣市編列下水道經費為例，編列最少的前五名分別為南投縣270萬、臺東縣350萬、嘉義縣400萬、云林縣500萬、屏東縣900萬。

　　他說，這次淹水的地方，如果把經費跟人口來比較，換算下來每位縣民分配到的經費不到10元，“比一顆茶葉蛋還要少”，顯見地方政府不重視都市排水。